制備液相色譜儀的原理是在原始的經典色譜法基礎上面引用氣象色譜的理論，把原來的流動性改變為壓力可達到4.9′107Pa。色譜柱則是用特殊的方式用小顆粒裝填而成。造成的結果就是色譜柱的柱效遠遠高于原始的經典液相色譜。并且它柱子使用后還能具有高度靈敏度檢測器。能夠對流出來的分析物進行連續檢測。